Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CREB1P16220 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREB1P16220 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms