Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMC1P11047 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMC1P11047 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms