Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HKR1P10072 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HKR1P10072 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HKR1P10072 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HKR1P10072 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HKR1P10072 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
HKR1P10072 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HKR1P10072 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HKR1P10072 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HKR1P10072 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms