Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACAA1P09110 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms