Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NGFRP08138 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NGFRP08138 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NGFRP08138 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NGFRP08138 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NGFRP08138 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NGFRP08138 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NGFRP08138 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NGFRP08138 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NGFRP08138 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NGFRP08138 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NGFRP08138 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NGFRP08138 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NGFRP08138 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NGFRP08138 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NGFRP08138 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NGFRP08138 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NGFRP08138 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NGFRP08138 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NGFRP08138 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms