Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSMBP08118 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSMBP08118 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSMBP08118 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSMBP08118 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSMBP08118 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MSMBP08118 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSMBP08118 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSMBP08118 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSMBP08118 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSMBP08118 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSMBP08118 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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MSMBP08118 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSMBP08118 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSMBP08118 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSMBP08118 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSMBP08118 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSMBP08118 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSMBP08118 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSMBP08118 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSMBP08118 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSMBP08118 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSMBP08118 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSMBP08118 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MSMBP08118 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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