Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FGGP02679 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FGGP02679 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FGGP02679 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FGGP02679 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FGGP02679 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FGGP02679 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FGGP02679 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms