Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA1P02647 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA1P02647 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOA1P02647 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOA1P02647 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA1P02647 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA1P02647 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA1P02647 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA1P02647 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA1P02647 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA1P02647 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA1P02647 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA1P02647 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms