Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNAPINO95295 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms