Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCNKO75909 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCNKO75909 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCNKO75909 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCNKO75909 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCNKO75909 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCNKO75909 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNKO75909 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNKO75909 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNKO75909 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNKO75909 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNKO75909 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNKO75909 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNKO75909 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNKO75909 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNKO75909 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNKO75909 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNKO75909 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNKO75909 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCNKO75909 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159 ms