Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F6O75461 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F6O75461 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2F6O75461 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2F6O75461 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2F6O75461 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2F6O75461 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F6O75461 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F6O75461 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F6O75461 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms