Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPF40AO75400 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms