Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LANCL1O43813 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms