Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD3O43242 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD3O43242 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD3O43242 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD3O43242 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD3O43242 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD3O43242 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD3O43242 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PSMD3O43242 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PSMD3O43242 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms