Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIBO00712 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIBO00712 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIBO00712 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIBO00712 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIBO00712 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIBO00712 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIBO00712 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIBO00712 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIBO00712 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIBO00712 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIBO00712 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIBO00712 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIBO00712 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIBO00712 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIBO00712 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIBO00712 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFIBO00712 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIBO00712 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIBO00712 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIBO00712 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIBO00712 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIBO00712 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIBO00712 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIBO00712 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIBO00712 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIBO00712 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIBO00712 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIBO00712 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFIBO00712 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFIBO00712 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIBO00712 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIBO00712 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIBO00712 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIBO00712 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIBO00712 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIBO00712 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIBO00712 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIBO00712 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIBO00712 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIBO00712 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIBO00712 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIBO00712 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIBO00712 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIBO00712 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIBO00712 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIBO00712 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIBO00712 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFIBO00712 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFIBO00712 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms