Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NCBP2LA6PVI3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NCBP2LA6PVI3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms