Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms