Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C9orf170A2RU37 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms