Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0D9SFI3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0D9SFI3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0D9SFI3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0D9SFI3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0D9SFI3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0D9SFI3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0D9SFI3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A0D9SFI3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A0D9SFI3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A0D9SFI3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0D9SFI3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms