Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR636-201ENST00000384825 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGLV3-25-201ENST00000390305 380 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRBV7-6-201ENST00000390374 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPACA3-203ENST00000394638 508 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z83841.1-201ENST00000433173 968 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PGAM4-201ENST00000458128 765 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRTDAP-203ENST00000484218 451 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL169P-201ENST00000485643 289 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01341-205ENST00000509202 503 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC023794.3-204ENST00000510754 236 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC233724.4-201ENST00000511894 267 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCARNA16-201ENST00000515981 187 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP409-201ENST00000516815 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC246817.2-201ENST00000523971 577 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLN-202ENST00000525934 436 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PROSER3-207ENST00000537459 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADGRG1-203ENST00000540164 3820 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 FXYD5-207ENST00000541435 898 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ENSAP2-201ENST00000554405 352 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016590.2-201ENST00000592319 375 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL355376.2-202ENST00000604686 241 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NDUFC2-KCTD14-203ENST00000612612 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 Metazoa_SRP.142-201ENST00000612810 316 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL139351.1-201ENST00000622092 320 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012629.4-201ENST00000623327 259 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005691.1-201ENST00000624723 401 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA17B-202ENST00000626886 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 GIT2-204ENST00000361006 5444 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHYHIPL-202ENST00000373880 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDK4-201ENST00000005178 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ESR2-208ENST00000554572 3588 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MSH5-SAPCD1-207ENST00000493662 3991 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 DDX23-201ENST00000308025 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP32P1-201ENST00000341745 3233 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPM3-202ENST00000357533 5145 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 LARP4-204ENST00000429001 4000 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MSH4-201ENST00000263187 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSNK1A1-201ENST00000261798 6067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 SFI1-204ENST00000400289 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 C6orf222-201ENST00000437635 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPV3-211ENST00000616411 5742 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 NLRC5-217ENST00000539144 6505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 POLR2J3-215ENST00000511313 4630 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 OSGIN2-201ENST00000297438 4209 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TECPR2-201ENST00000359520 8686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 EMC1-207ENST00000477853 6664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPS1-201ENST00000220888 5480 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CXorf36-202ENST00000398000 4655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CALD1-203ENST00000393118 4281 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TGFBR1-209ENST00000552516 5933 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCBP2-205ENST00000447282 3077 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC25A25-AS1-201ENST00000418747 6391 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 C3P1-201ENST00000495140 3526 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC083805.1-201ENST00000499481 3507 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLDN19-203ENST00000539749 3517 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC118344.2-201ENST00000622968 4765 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF438-202ENST00000361310 3144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPTAN1-201ENST00000358161 7794 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNTN2-212ENST00000638378 4447 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTC30B-201ENST00000408939 4017 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 VWA3B-213ENST00000477737 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 HS6ST3-202ENST00000620595 7073 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAD17-213ENST00000509734 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.1 ms