Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
GRIK4Q16099 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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