Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008467.1-201ENST00000512693 5471 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SIRPA-201ENST00000356025 3867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 WASHC5-201ENST00000318410 4187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RPH3A-202ENST00000415485 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TTLL13P-206ENST00000641754 2256 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CHD3-202ENST00000358181 7286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 QARS-202ENST00000414533 2412 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DSTYK-201ENST00000367161 7739 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CDK16-204ENST00000457458 3158 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00294-201ENST00000631190 3306 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 OTOA-204ENST00000388958 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC093525.7-201ENST00000569852 3626 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCB9-204ENST00000392439 3791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 OTUB2-201ENST00000203664 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 WWP2-201ENST00000356003 4227 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC144A-206ENST00000399273 8686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 XPO7-202ENST00000433566 4519 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 OR1K1-201ENST00000277309 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ERCC1-202ENST00000300853 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 IDSP1-201ENST00000324799 376 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RYR1-201ENST00000355481 15377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5S9-201ENST00000364451 119 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ABL1-202ENST00000372348 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RACK1-201ENST00000376817 965 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DEFA1B-201ENST00000382689 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DLAT-202ENST00000393051 3517 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HPS5-203ENST00000396253 4725 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ADA2-204ENST00000399839 3986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 OR13E1P-201ENST00000417104 922 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX11L5-201ENST00000421620 654 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590640.1-201ENST00000425205 379 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 C1orf198-202ENST00000427697 3666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00475-207ENST00000438322 424 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL137027.1-201ENST00000440358 444 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP5J2LP-201ENST00000444161 235 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 Z98751.2-201ENST00000468716 451 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL116P-201ENST00000470786 305 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CRYZP2-201ENST00000504217 1049 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC083906.3-201ENST00000509201 466 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 STK32B-204ENST00000510398 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008667.1-201ENST00000515296 568 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC100849.2-201ENST00000518324 519 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNPO-204ENST00000519664 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV1-67-201ENST00000519713 357 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC103855.2-202ENST00000527642 568 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008740.1-201ENST00000549658 255 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFHX2-AS1-203ENST00000556354 931 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022748.1-202ENST00000566323 195 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CDRT15P1-201ENST00000577632 564 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4274-201ENST00000579577 91 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3689B-201ENST00000581772 148 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL616P-201ENST00000584555 269 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LSP1P1-201ENST00000599825 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 BOLA2P2-201ENST00000603861 250 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFC2-KCTD14-204ENST00000614236 386 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC105020.5-201ENST00000614810 423 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6760-201ENST00000617342 68 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6732-201ENST00000619365 60 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AL035420.3-201ENST00000619647 321 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092278.1-201ENST00000621951 745 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RHOXF1P2-201ENST00000635431 502 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 AFAP1-202ENST00000360265 7479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 TYW5-201ENST00000354611 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 XIAP-201ENST00000355640 8584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 HDAC6-201ENST00000334136 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP3-206ENST00000391828 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP4-12Q9BQ66 CD302-204ENST00000553424 3866 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.5 ms