Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RN7SL680P-201ENST00000620379 299 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SLC8A3-208ENST00000533541 3409 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RBM43-201ENST00000331426 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 OR7D2-201ENST00000344248 3224 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 NELL2-217ENST00000551601 3148 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 WDR7-202ENST00000357574 7213 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
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MKRN4PQ13434 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
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MKRN4PQ13434 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC005518.2-201ENST00000603254 282 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC073488.8-201ENST00000631952 757 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
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MKRN4PQ13434 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SUPT6H-201ENST00000314616 6523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
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MKRN4PQ13434 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
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MKRN4PQ13434 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SLC2A3-201ENST00000075120 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 ARMCX7P-201ENST00000372828 562 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC007547.2-201ENST00000468802 360 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 TMEM267-202ENST00000500337 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SCARNA20.1-201ENST00000516009 138 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
MKRN4PQ13434 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
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