Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATG4BQ9Y4P1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATG4BQ9Y4P1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms