Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1DQ9Y2S0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms