Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC4Q9Y296 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms