Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HIGD1AQ9Y241 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HIGD1AQ9Y241 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms