Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM35Q9UPQ4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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