Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms