Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms