Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOMER3Q9NSC5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOMER3Q9NSC5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms