Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPCPD1Q9NPB8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPCPD1Q9NPB8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPCPD1Q9NPB8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPCPD1Q9NPB8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPCPD1Q9NPB8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPCPD1Q9NPB8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPCPD1Q9NPB8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPCPD1Q9NPB8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPCPD1Q9NPB8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPCPD1Q9NPB8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPCPD1Q9NPB8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPCPD1Q9NPB8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms