Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms