Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8X3

LINC00574, Putative uncharacterized protein LINC00574, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00574Q9H8X3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00574Q9H8X3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms