Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDCL3Q9H2J4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms