Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TDRD1Q9BXT4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms