Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB1Q9BVT8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMUB1Q9BVT8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMUB1Q9BVT8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMUB1Q9BVT8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMUB1Q9BVT8 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMUB1Q9BVT8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms