Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RUSC1Q9BVN2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RUSC1Q9BVN2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms