Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP58Q9BVL2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP58Q9BVL2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms