Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MCMBPQ9BTE3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MCMBPQ9BTE3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms