Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NICN1Q9BSH3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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