Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM175Q9BSA9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms