Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC39A3Q9BRY0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms