Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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TM2D3Q9BRN9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TM2D3Q9BRN9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TM2D3Q9BRN9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TM2D3Q9BRN9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TM2D3Q9BRN9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TM2D3Q9BRN9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TM2D3Q9BRN9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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TM2D3Q9BRN9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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TM2D3Q9BRN9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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TM2D3Q9BRN9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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TM2D3Q9BRN9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TM2D3Q9BRN9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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