Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPOCK3Q9BQ16 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms