Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GAL3ST1Q99999 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GAL3ST1Q99999 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms