Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRBNQ96SW2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms