Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SIN3AQ96ST3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3AQ96ST3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms