Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF6

COQ10A, Coenzyme Q-binding protein COQ10 homolog A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ10AQ96MF6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
COQ10AQ96MF6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COQ10AQ96MF6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms