Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SAMD8Q96LT4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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